$(10$p$)$ Apply the Horspool's algorithm to search for the given pattern $($gene segment$)$ in the given DNA sequence. Construct the shift table and illustrate and count comparisons as described in class.

DNA sequence $=$ TAGCTCTTTTAAAAGTGTCCGATTCCA

Gene segment $=$ ATTCCA

Shift table

$\backslash$table$[[$A$,$C$,$G$,$T$],[,,,]]$

Total number of comparisons $=$

$\backslash$table$[[T,$A$,$G$,$C$,T,$C$,T,T,T,T,$A$,$A$,$A$,$A$,$G$,T,$G$,T,$C$,$C$,$G$,$A$,T,T,$C$,$C$,$A$],[,,,,,,,,,,,,,,,,,,$t$,,,,,,,,],[,,9,,,,$IF$,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,],[,,\text{'},,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,],[,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,],[,,,,,,,,,,,,,,,,,e_1,,,,,,,,,],[,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,],[,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,],[,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,],[,,,,,,,,,,,,,,,,,,,4,,,,,,,],[,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,],[,,,,,$c$,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,],[,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,],[,,,,,,,,,,,,,,,,,2,,,,,,,,,],[,,,,6,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,],[,,,,,,,8,,,,,,,,,,,,7,,,,,,,],[,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,],[,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,],[,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,],[,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,],[,,,,,,,,,,,,,,,,,4,,,,,,,,,],[,,,,,,,,,,,,,,85,,,,,,,,,,,,],[,,,,,,,,,*,,,,,10,,,,,,,,,,,,],[,,,,,,,,,,,*,,,,,,8,,,,,,,,,],[,,,,,,,,5,,,,,,,,,,,,,,,,,,],[,,,,,,,,,,,,,,,,,,,$s$,,,,,,,],[,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,],[,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,],[,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,]]$